您所在的位置: 首页 > 行业软件 > 健康医药 > gene codes sequencher(DNA序列分析入拼接软件) V5.4.44511

gene codes sequencher(DNA序列分析入拼接软件) V5.4.44511

是一款DNA序列分析入拼接软件

  • 软件大小:221249536 MB
  • 软件类型:国产软件
  • 软件分类:行业软件 / 健康医药
  • 软件语言:英文
  • 软件授权:免费软件
  • 更新时间:2019-03-20 16:40:27
  • 支持系统:Vista/winXP/win7/win8/win10

安装不了?查看安装教程

手机扫一扫快捷方便下载

本类应用推荐

本类最新

应用介绍

Gene Codes Sequencher是一款DNA序列分析入拼接软件.通过将最新的命令行的同行评议NGS算法使台式科学家进入一个直观的指向和点击界面。它是DNA序列分析的工业标准软件。它可以和所有的自动序列分析仪一同工作,并且因为它的极速Contig组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具,以及卓越的技术支持而众所周知。

gene codes sequencher(DNA序列分析入拼接软件) V5.4.44511 _52z.com

基本简介

无论是执行基准制导路线,从头组装、变型呼叫、或SNP分析,Sequencher都拥有你需要去获取结果的答案。Gene Codes Sequencher 5.4.44511为深入的转录分析和您的RNA测序数据的基因差异表达集成了综合的袖扣套件。

使用Gene Codes Sequencher 5.4.44511可以很容易的生成您的RNA测序数据的独特可视化,包括自定义曲线和图表,让你在几秒钏内准备好以图形方式显示。equencher 是 DNA 序列分析的工业标准软件。它可以和所有的自动序列分析仪一同工作,并且因为它的极速 Contig 组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具,以及卓越的技术支持而众所周知。从差不多 15 年前释出第一个版本到现在,Sequencher 在每个基因专业和制药公司中都应用与于序列分析任务,同时在全球超过40个国家里为数众多的学术和政府实验室中使用。Sequencher 被生命科学研究者们使用于许多不同的 DNA 序列分析应用方面,包括基因重组、突变检测、法医的人体辨别,以及分类学等等...

Sequencher 的能力包括杂合子和 SNP 的检测和分析,cDNA 到 染色体 DNA 的大型间隙对准,比较排序,对置信评分的支持、ORF 转换、基因银行特性化导入、以及限制酶映射等等。

功能介绍

Sequencher 产品特性:

SNP 检测 (SNP Detection)

序列装配 (Sequence Assembly)

序列编辑 (Sequence Editing)

自动分析 (Automated Analysis)

矢量微调 (Vector Trimming)

SNP 检测

使用 Sequencher 来进行比较对准以便鉴别和报告 SNP 以及突变。

例如,调用第二峰..功能分析你的所有序列以寻找潜在的杂合子。你可以控制定义一个杂合子的严格度。

Sequencher 中国总代理

在装配总揽中表示出所有杂合子的位置。

Sequencher 中国总代理

你可以从一个杂合子跳到下一个,而仅仅需要在 Base View 里面按一下空格键。你还可以观察一致及其参考序列的转换。

一致及其参考序列的区别会列在一个可导出的表格内。参考序列确保从一个装配到下一个装配时,SNP 的数目保持一致。

序列装配

Sequencher 的装配算法可以将你的 DNA 片断快速而又准确的装配起来。自觉的工具允许你在数秒内就可以设置好参数并且调整它们。

你完全可以不顾方向的装配序列。Sequencher 会比较前端和反转补体方向来装配最可能的 Contig。

将 Sequencher 的多功能装配工具应用到:

确定矢量构造

装配病毒和细菌基因组

从 cDNA 库中聚类数以万计的序列

将基因变体和一个参考序列做对比

创建一个引物地图

将 cDNA 装配成基因组序列

以及其他许多项目...

Sequencher 能够给你足够的信心认为一个序列是绝对正确的。你可以只观察一个序列的色谱图,你也可以从前端或反方向同时查看多个对齐的色谱图。 在你的已对齐数据中滚动是很容易的。你可以使用 Sequencher 的选择工具来高亮不一致或者低质量的区域。

自动分析

Sequencher 可对你的数据进行批处理,这个过程是透明、用户可定义、可恢复的,并且 Sequencher 从不为了自动化的目的而破坏你科学结论的正确性。

当你工作在多个序列时,Sequencher 可以:

调用第二峰

调整矢量

调整低质量的尾端

创建一致序列

恢复到实验数据

Sequencher 总是管理两份数据,一份编辑过的,一份则是原始的导入数据。当你应用“Revert to Experimental Data”命令到在你项目中已选定的序列或者在一序列中的选中部分时,你可以撤销所有或者部分编辑动作。

自从 4.5 以后,Sequencher 就包含了一个新的自动化工具,“Assemble by Name”。依靠“Assemble by Name”,你可以选择片段名的一部分作为一个共享的标识符,或者说是“装配句柄”。Sequencher 就可以将选择和名字自动转换为 Contig。例如,仅仅通过一个按钮的点击,你就可以将 90 个文件,45对前端和反向序列转换成 45 个根据你的病人编号命名的 Contig。装配参数的每个变化都会重组你的片段,因此你可以根据克隆编号、日期、引物,或者其他任何你记录在序列名称中的特征,来装配 Contig。

如果你做了许多排序,你会感激“Assemble by Name”,尤其是在你有许多个带有一个标准引物集的样本序列时。事实上,任何在序列名中具有可用信息人的人,都有可能使用“Assemble by Name”。一些应用包括:

用于身份鉴定和人口研究的 MHC 和线粒体基因排序。

候选基因的 PCR 产品的分析。

对保存的跨系统分类物种基因的排序。

通过跟踪病毒对抗病毒剂或疫苗的抗药性,对病毒序列进行监控。

即使在项目中只有一个 Contig,“Assemble by Name”仍然是有用的,因为它确保 Contig 的名称可以精确的表述样本的名称。如果你有命名为“Bob”的样本,那么正确命名你的 Contig 并不是什么难事,但但你有象“Bob-2309888762-4321”这样更复杂的名字时,允许 Sequencher 命名你的 Contig 是非常有用的。

矢量调整

自动排序器以基础调用错误生成结果。从 DNA 库克隆的序列通常包括矢量序列、polyA 尾,或其他不相关序列。内含子和引物序列通常会和放大的外显子序列侧面相连。不调整的话,这些污染物会扭曲你的装配和下游分析。 Sequencher 允许你调整低质量或者含糊的数据。“Trim Ends”将令人误解的数据从序列片段的尾部去除。“Trim Vector”将污染序列尾部的特定序列数据移除。“Trim to Reference”剔除超出装配参考序列的序列尾部。

在执行一个调整之前,Sequencher 会显示一个计划调整的图形描述,这个功能甚至允许你重新定义你的条件。

下载地址

猜你喜欢

连击契约V1.0 变态版
连击契约V1.0 变态版
连击契约安卓变态版是一款超级好玩的战斗魔幻题材角色扮演手游。游戏有着非常棒的魔幻背景,超多人物让你目不暇接,你可以选择不同的角色分别进行游戏,有着非常棒的觉醒转职系统,让你在这款游戏中不停的解锁...

你可能还喜欢

  • 躺平生存者 2022-05-15
    躺平生存者
    52z飞翔小编为大家带来了【躺平生存者游戏合集】,轻松刷图杀怪升级,别看是像素画风玩起来是真的不错,不断提高自己实力。如果你对这款游戏感兴趣的话,那么就赶快下载吧。
  • 僵尸战争死亡之路 2022-05-14
    僵尸战争死亡之路
    52z飞翔小编为大家带来了【僵尸战争死亡之路游戏合集】,在这个卡通世界可以体验到极致精彩的冒险挑战,每一个玩家都可以成为强大的勇士,在游戏之中通过不断的挑战来证明自己。如果你对这款游戏感兴趣的话,那么就赶快下载吧。
  • 废铁轮舞曲 2022-05-13
    废铁轮舞曲
    52z飞翔小编为大家带来了【废铁轮舞曲游戏合集】,灵活的操作对抗对手,沉浸式的游戏体验,玩家们可以获得很多的技能,熟悉的战斗体验,完成一系列的战斗的任务,提升自己角色的战斗力。如果你对这款游戏感兴趣的话,那么就赶快下载吧。
  • 与袖珍手办相伴的日常 2022-05-13
    与袖珍手办相伴的日常
    52z飞翔小编整理了【与袖珍手办相伴的日常·游戏合集】,提供与袖珍手办相伴的日常安卓/汉化版/手机版、与袖珍手办相伴的日常百度云下载。让你能在剧情中遇到更有趣的服务,让你能靠自己的选择来更好地接触到女友,让你更好地体验到自己的魅力,让你能轻松地面对剧情中更有趣的服务,喜欢的朋友,还在犹豫什么!快去下载游戏体验吧。
  • 被魅魔盯上的村庄 2022-05-13
    被魅魔盯上的村庄
    52z飞翔小编整理了【被魅魔盯上的村庄·游戏合集】,提供被魅魔盯上的村庄安卓/汉化版/手机版、被魅魔盯上的村庄百度云下载。被魅魔盯上的村庄是一款由[三つ雨]制作组出品的日式RPG游戏。本游戏是一款融合了探索、互动、NTR玩法的角色扮演作品,玩家将控制童贞主人公带着两名女助手前来【驱魔】。
  • 我们永远在这里 2022-05-13
    我们永远在这里
    52z飞翔小编整理了【我们永远在这里·游戏合集】,提供我们永远在这里中文版、我们永远在这里全DLC整合版/steam免费版/完整版、我们永远在这里百度云下载。你和你的同伴被困在城堡岩中——你是被背叛了,还是你根本没有那么聪明?52z分享我们永远在这里下载,要逃跑,你必须探索险恶的城堡寻找谜题,并一起计划逃跑。
  • 神秘跳跳梯 2022-05-12
    神秘跳跳梯
    52z飞翔小编为大家带来了【神秘跳跳梯游戏合集】,带给玩家精彩多样的游戏体验,不断尝试各种不同的乐趣,为玩家带来十分生动的游戏体验,考验你的反应力和预判,把握好跳跃的节奏,获取更高的分数与好友一争高下吧。
  • 宝物猎人舞传说之宝 2022-05-12
    宝物猎人舞传说之宝
    52z飞翔小编整理了【宝物猎人舞传说之宝·游戏合集】,提供宝物猎人舞传说之宝安卓/中文版/手机版、宝物猎人舞传说之宝百度云下载。本站为游戏玩家提供了宝物猎人舞传说之宝完整中文官方,通过各种剧情的尝试,不断地体验更多的宝藏的搜寻,在这里去尽情的探索,尽情战斗吧。感兴趣的就一起来玩吧。
  • 末世危情 2022-05-12
    末世危情
    52z飞翔小编整理了【末世危情·游戏合集】,提供末世危情安卓/汉化版/手机版、末世危情百度云下载。本站为玩家提供了末世危情免费汉化完整全CG版,玩家可以在这里去经历到各种不同的挑战,通过自己的方式,击败各种不同的对手,享受到各种福利的模式。感兴趣的就一起来玩吧。

下载声明 | 法律声明 | 版权声明 | 友情链接 | 发布软件 | 最新更新

本站为非盈利性网站,不接受任何广告。本站所有资源均由网友上传,如有侵权,请发邮件至 hnrshwl@163.com

琼ICP备2022006426号-1